Em outubro de 2006, o Comitê da Bacia Hidrográfica dos rios Sorocaba e Médio Tietê – CBH-SMT, elegeu a Presidência e os Conselhos Fiscal e Deliberativo da Fundação Agência de Bacia, e para compor o Conselho Fiscal, a Sociedade Civil indicou o Sintaema. A gestão 2005-2007 do CBH-SMT foi considerada uma das melhores gestões dos últimos 12 anos, segundo representantes do colegiado. A agenda de trabalhos foi intensa e muitas ações importantes para o Comitê foram realizadas, como a assinatura do aditivo ao protocolo de intenções com a Companhia Brasileira de Alumínio e o Plano de Bacias, entre outros. Nessa gestão, há o objetivo de se intensificar os trabalhos do Programa de Aceleração do Crescimento – PAC na área de meio ambiente e a implantação da cobrança pelo uso da água a partir de 2008. O representante do SINTAEMA, Ghandi Pires Fraga, foi reeleito pelo segmento sociedade civil para compor a plenária do Comitê, para a gestão 2007-2009.
